את השכלתו האקדמית רכש עמיר ב- London School of Economics שם למד לתואר ראשון בכלכלה, ובהמשך השלים את לימודי ה- MBA עם התמחות במימון במרכז הבינתחומי בהרצליה. בשנת 2016, פרש מהשירות הביטחוני לטובת התמקדות בתחום החינוך. במסגרת זו סיים את בית הספר מנדל למנהיגות חינוכית ומכהן כמנכ"ל בית איזי שפירא החל מספטמבר 2020. עמיר נשוי לעירית ואב לארבעה ילדים.